(1) 断线问题由于在切割加工时，加工液的流动不良或是线材的过度振动，都会造成线材断裂的现象，一旦线材断掉后，操作员通常必须重设，穿线等反复的动作，不仅加工效率降低，加工精度也会受到影响。有鉴于此，瑞士的有名放电机厂及日本的各大厂已研发出自动穿线的系统，不仅无须人工操，而且可以记忆断线的位置，重新设定，大大提高加工效率及精度。
(2) 切割直角时产生圆弧的问题
在切割直角时，虽然线放电加工机XY轴可控制行走90°的转角，但是在放电过程中，特别是转角处通常都会产生圆弧的现象。控制放电状况可尽量避免圆弧状况发生，或是利用更微细线也有相同的效果，但是改善的程度仍有限。要做高精度的线切割加工时，转角所产生的圆弧现象，是极待解决的问题。
(3) 超威细线切割加工
目前一般线切割放电加工机大部份使用ψ200μm的黄铜线，也有少部份的使用ψ150μm以下的细铜线。当然使用的线愈细，断线的机率就愈大，然而为了切割更微细的部品，目前也有不少厂家使用约ψ30μm的钨线做微细切割加工，该种线材极为昂贵，非附加价值高的加工，较少使用，日后想必ψ30μm以下的细线如ψ20，ψ10等线材也会渐渐被采用。
(4) 高厚度的线切割加工
线切割加工时，工件的厚度愈厚，线的振动程度愈大，就愈容易断线。目前有些厂家（瑞士，日本）已经推出可切割厚度１公尺以上工件的线切割放电加工机，除了可以连续切割不断线外，也可保证加工精度。


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